Für die Belange des Naturschutzes und der Landschaftspflege ist die Stadt Wilhelmshaven als Untere Naturschutzbehörde zuständig. Der Aufgabenbereich umfasst u. a. die Naturschutzfachplanung, insbesondere die Erstellung und Fortschreibung des Landschaftsrahmenplans/Landschaftsplans der Stadt, die Sicherung des Ausgleichsflächenbedarfs und der Maßnahmenumsetzung bei Eingriffen in Natur und Landschaft (z. B. durch Bebauung), die Ausweisung von Schutzgebieten (Übersichtskarte) und den Artenschutz. Der Fachbereich Umwelt (Abteilung Naturschutz und Landschaftspflege) nimmt auch den Aufgabenbereich der Unteren Waldbehörde wahr.